2013年4月，上海理工大学成立“协同创新工作领导小组”，校长胡寿根任组长。

6月25日，学校成立“协同创新研究院”。研究院在“协同创新工作领导小组”领导下开展工作，履行校级协同创新相关管理工作职能和二级学院（研究院）工作职能。刘平副校长兼任研究院院长，科技处处长兼任常务副院长，规划处、研究生院、人事处、资产经营公司负责人兼任副院长，并设专职副院长1名。